第21集Michael在得知Percy决定命令组织去杀死任何能破解黑盒的人之后，他派出Nikita去拯救名单上的最后一个人，一个来自CIA的分析师Malcolm.Nikita绑架了分析师，并把他带到了Ryan那里，而与此同时，Percy突然对Alex发动攻击。第22集一场针对美国的袭击即将来临，Ryan不得不以失去在CIA工作的风险，把Nikita从CIA的监禁中拯救出来，与此同时，Birkhoff同学打算弃暗投明离开组织，但是却在离开前指出Micheal是Nikita那一伙的，而Alex则会在大结局中，被困在组织，这个无比危险的地方。